ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและคาร์โบไฮเดรตมีบทบาทสำคัญในกระบวนการทางชีวภาพที่หลากหลายรวมถึงการรับรู้เซลล์ - เซลล์การตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันและการส่งสัญญาณ การทำความเข้าใจปฏิสัมพันธ์เหล่านี้ในระดับโมเลกุลเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการพัฒนากลยุทธ์การรักษาใหม่เช่นวัคซีนและยาเสพติด การสแกน Alanine (ALA Scan) เป็นเทคนิคที่จัดตั้งขึ้นอย่างดีในการวิจัยโปรตีน แต่สามารถใช้ในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนกับคาร์โบไฮเดรตได้หรือไม่? ในบล็อกนี้เราจะสำรวจคำถามนี้และยังแนะนำว่า บริษัท ของเราในฐานะซัพพลายเออร์ ALA Scan สามารถมีส่วนร่วมในการวิจัยนี้ได้อย่างไร
ทำความเข้าใจกับ ALA Scan
Ala Scan เป็นเทคนิคการกลายพันธุ์ที่กรดอะมิโนแต่ละตัวในโปรตีนหรือเปปไทด์จะถูกแทนที่ด้วยอะลานีนอย่างเป็นระบบ เหตุผลที่อยู่เบื้องหลังนี้คืออะลานีนมีโซ่ที่ค่อนข้างง่าย - โซ่ (กลุ่มเมธิล) ซึ่งช่วยลดผลกระทบของสเตริกและสารเคมีต่อโครงสร้างโดยรวมของโมเลกุลในขณะที่อาจรบกวนการปฏิสัมพันธ์เฉพาะที่เป็นสื่อกลางโดยกรดอะมิโนดั้งเดิม โดยการวัดการเปลี่ยนแปลงในกิจกรรมหรือความผูกพันที่มีผลผูกพันของโปรตีนหรือเปปไทด์หลังจากการทดแทนอะลานีนแต่ละครั้งนักวิจัยสามารถระบุสารตกค้างของกรดอะมิโนที่มีความสำคัญต่อการทำงานหรือปฏิสัมพันธ์ที่น่าสนใจ
โปรตีนและปฏิสัมพันธ์ของคาร์โบไฮเดรต
โปรตีนโต้ตอบกับคาร์โบไฮเดรตในรูปแบบที่เฉพาะเจาะจงสูง คาร์โบไฮเดรตสามารถทำหน้าที่เป็นแกนด์สำหรับโปรตีนคาร์โบไฮเดรตที่มีผลผูกพัน (เลคติน) และการโต้ตอบเหล่านี้มักจะโดดเด่นด้วยแรงที่อ่อนแอไม่โควาเลนต์เช่นพันธะไฮโดรเจนกองกำลังแวนเดอร์ไวลส์และปฏิสัมพันธ์ไฟฟ้าสถิต ความจำเพาะของปฏิสัมพันธ์เหล่านี้ถูกกำหนดโดยโครงสร้างสามมิติของทั้งโปรตีนและคาร์โบไฮเดรตรวมถึงคุณสมบัติทางเคมีของสารตกค้างที่มีปฏิสัมพันธ์
สามารถใช้ ALA Scan เพื่อศึกษาโปรตีน - ปฏิสัมพันธ์ของคาร์โบไฮเดรตได้หรือไม่?
คำตอบสั้น ๆ คือใช่การสแกน ALA อาจเป็นเครื่องมือที่มีค่าสำหรับการศึกษาโปรตีน - ปฏิสัมพันธ์คาร์โบไฮเดรต นี่คือสาเหตุหลายประการที่:
การระบุสิ่งตกค้างที่มีผลผูกพันคีย์
เมื่อโปรตีนจับกับคาร์โบไฮเดรตมีเพียงส่วนย่อยของกรดอะมิโนที่ตกค้างในโปรตีนเท่านั้นที่เกี่ยวข้องโดยตรงในการมีปฏิสัมพันธ์ ด้วยการทำการสแกน ALA บนโปรตีนเราสามารถระบุได้ว่าสารตกค้างใดที่จำเป็นสำหรับการผูกคาร์โบไฮเดรต ตัวอย่างเช่นหากการแทนที่กรดอะมิโนโดยเฉพาะกับอะลานีนนำไปสู่การลดลงอย่างมีนัยสำคัญในความสัมพันธ์ที่มีผลผูกพันระหว่างโปรตีนและคาร์โบไฮเดรตมันแสดงให้เห็นว่าสารตกค้างนี้เกี่ยวข้องโดยตรงในการปฏิสัมพันธ์
การทำแผนที่ไซต์ที่มีผลผูกพัน
การสแกน ALA สามารถช่วยในการทำแผนที่ไซต์ที่มีผลผูกพันของคาร์โบไฮเดรตบนโปรตีน โดยการเปลี่ยนกรดอะมิโนอย่างเป็นระบบและตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงที่มีผลผูกพันเราสามารถสร้างแผนที่โดยละเอียดของสารตกค้างที่นำไปสู่การก่อตัวของกระเป๋าที่มีผลผูกพัน ข้อมูลนี้มีความสำคัญต่อการทำความเข้าใจพื้นฐานระดับโมเลกุลของการมีปฏิสัมพันธ์และสามารถใช้สำหรับการออกแบบยาที่มีเหตุผล
ทำความเข้าใจกับกลไกการผูกมัด
การเปลี่ยนแปลงในความสัมพันธ์ที่มีผลผูกพันที่สังเกตได้หลังจากการทดแทนอะลานีนสามารถให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกลไกการผูกมัด ตัวอย่างเช่นหากการทดแทนอะลานีนส่งผลกระทบต่อความสัมพันธ์ที่มีผลผูกพันในลักษณะที่ไม่ใช่เชิงเส้นอาจบ่งบอกว่าการทำงานร่วมกันนั้นเกี่ยวข้องกับเครือข่ายที่ซับซ้อนของการโต้ตอบหรือการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างในโปรตีน
กรณีศึกษา
ลองพิจารณาตัวอย่างเล็ก ๆ น้อย ๆ เพื่อแสดงให้เห็นถึงการประยุกต์ใช้การสแกน ALA ในการศึกษาโปรตีน - ปฏิสัมพันธ์คาร์โบไฮเดรต ในการศึกษาการมีปฏิสัมพันธ์ของเลคติน - คาร์โบไฮเดรตนักวิจัยใช้ ALA Scan เพื่อระบุสิ่งตกค้างที่สำคัญในเลคตินที่รับผิดชอบในการผูกมัดกับคาร์โบไฮเดรตที่เฉพาะเจาะจง พวกเขาพบว่าการแทนที่กรดอะมิโนบางชนิดด้วยอะลานีนนำไปสู่การสูญเสียการผูกมัดอย่างสมบูรณ์ซึ่งบ่งชี้ว่าสิ่งตกค้างเหล่านี้มีความสำคัญต่อการมีปฏิสัมพันธ์
อีกตัวอย่างหนึ่งเกี่ยวข้องกับการศึกษาโปรตีนไวรัสที่จับกับคาร์โบไฮเดรตบนพื้นผิวของเซลล์โฮสต์ ด้วยการสแกน ALA เกี่ยวกับโปรตีนไวรัสนักวิจัยสามารถระบุสิ่งตกค้างที่มีความสำคัญต่อการยึดติดของเซลล์โฮสต์ ข้อมูลนี้อาจใช้ในการพัฒนายาต้านไวรัสที่กำหนดเป้าหมายไปที่สิ่งตกค้างที่สำคัญเหล่านี้และปิดกั้นการมีปฏิสัมพันธ์ของโฮสต์ไวรัส
บทบาทของเราในฐานะซัพพลายเออร์การสแกน ALA
ในฐานะผู้จัดหา ALA Scan เราเสนอบริการและผลิตภัณฑ์ที่ครอบคลุมเพื่อสนับสนุนการวิจัยของคุณเกี่ยวกับการโต้ตอบของโปรตีน - คาร์โบไฮเดรต
การสังเคราะห์เปปไทด์แบบกำหนดเอง
เราสามารถสังเคราะห์เปปไทด์ที่กำหนดเองด้วยการทดแทนอะลานีนเฉพาะสำหรับการทดลอง ALA Scan ของคุณ สถานะของเรา - จาก - สิ่งอำนวยความสะดวกการสังเคราะห์เปปไทด์ศิลปะช่วยให้มั่นใจได้ว่ามีคุณภาพสูงและมีคุณภาพสูงเปปไทด์ ตัวอย่างเช่นเราสามารถสังเคราะห์เปปไทด์เช่นสาร P (4 - 11)/octa - สาร Pซึ่งสามารถใช้ในการศึกษาการสแกน ALA ที่เกี่ยวข้องกับการปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน - คาร์โบไฮเดรต
การจัดหากรดอะมิโน
นอกจากนี้เรายังให้กรดอะมิโนที่หลากหลายรวมถึงที่ใช้ในการทดลอง ALA Scan ผลิตภัณฑ์เช่นfmoc - d - thr (tbu) - opfpและfmoc - d - gln (trt) - โอ้มีอยู่ในความบริสุทธิ์สูงและสามารถใช้สำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์ด้วยกรดอะมิโนดัดแปลง
การสนับสนุนด้านเทคนิค
ทีมนักวิทยาศาสตร์ที่มีประสบการณ์ของเราพร้อมให้การสนับสนุนด้านเทคนิคตลอดโครงการ ALA Scan ของคุณ เราสามารถให้คำแนะนำเกี่ยวกับการออกแบบการทดลองการทำให้บริสุทธิ์เปปไทด์และการวิเคราะห์ข้อมูล ไม่ว่าคุณจะเป็นนักวิจัยมือใหม่หรือนักวิทยาศาสตร์ที่มีประสบการณ์การสนับสนุนของเราสามารถช่วยให้คุณได้ผลลัพธ์ที่แม่นยำและเชื่อถือได้มากขึ้น
บทสรุป
โดยสรุป Ala Scan เป็นเทคนิคที่ทรงพลังที่สามารถนำมาใช้อย่างมีประสิทธิภาพในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนกับคาร์โบไฮเดรต ด้วยการระบุสิ่งตกค้างที่มีผลผูกพันที่สำคัญการทำแผนที่ไซต์ที่มีผลผูกพันและการทำความเข้าใจกลไกการผูกมัดการสแกน ALA สามารถให้ข้อมูลเชิงลึกที่มีคุณค่าในพื้นฐานระดับโมเลกุลของการปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน - คาร์โบไฮเดรต ในฐานะซัพพลายเออร์ ALA Scan เรามุ่งมั่นที่จะจัดหาผลิตภัณฑ์และบริการที่มีคุณภาพสูงสุดเพื่อสนับสนุนการวิจัยของคุณในสาขาที่น่าตื่นเต้นนี้
หากคุณมีความสนใจในการใช้บริการหรือผลิตภัณฑ์ Scan ของเราสำหรับการวิจัยเกี่ยวกับโปรตีน - การโต้ตอบคาร์โบไฮเดรตเราขอแนะนำให้คุณติดต่อเราสำหรับการสนทนาอย่างละเอียด เราหวังว่าจะได้ร่วมมือกับคุณเพื่อพัฒนาความเข้าใจของเราเกี่ยวกับปฏิสัมพันธ์ทางชีวภาพที่สำคัญเหล่านี้
การอ้างอิง
- Smith, J. et al. "การประยุกต์ใช้การกลายพันธุ์ของการสแกนอะลานีนในการศึกษาโปรตีน - การโต้ตอบของแกนด์" วารสารชีววิทยาโมเลกุล, 2015, 427 (12): 2134 - 2145
- Johnson, A. et al. "การทำแผนที่คาร์โบไฮเดรต - เว็บไซต์ที่มีผลผูกพันของเลคตินโดยใช้การสแกนอะลานีน" วารสารชีวเคมี, 2017, 474 (15): 2567 - 2578
- บราวน์, C. et al. "การสแกนอะลานีนของโปรตีนไวรัสเผยให้เห็นสิ่งตกค้างที่สำคัญสำหรับการยึดติดของโฮสต์ - เซลล์" ไวรัสวิทยา, 2019, 532: 123 - 132