มีสองวิธีหลักในการสังเคราะห์ไลบรารีเปปไทด์: วิธีโมโนเมอร์และวิธีซับโมโนเมอร์
วิธีโมโนเมอร์
วิธีโมโนเมอร์เป็นวิธีการดั้งเดิมสำหรับการสังเคราะห์ไลบรารีเปปไทด์ ในวิธีนี้ โมโนเมอร์ที่ได้รับการป้องกันทั้งหมดจะต้องถูกสังเคราะห์ก่อน และกระบวนการสังเคราะห์ของโมโนเมอร์ที่ได้รับการป้องกันแต่ละตัวนั้นยุ่งยากและใช้เวลานาน
วิธีโมโนเมอร์ทุติยภูมิ
วิธีโมโนเมอร์ทุติยภูมิไม่ต้องการโมโนเมอร์ที่มีหมู่อัลฟาอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน วิธีนี้ประกอบด้วยสองขั้นตอน: การทดแทนนิวคลีโอฟิลิกตามด้วยอะไซเลชัน วิธีซับโมโนเมอร์ช่วยให้สามารถใช้เอมีนที่มีขายทั่วไปหรือสังเคราะห์ได้ ที่มีศักยภาพสูงสำหรับเคมีเชิงผสม