เฮ้ ในฐานะซัพพลายเออร์ของสารตั้งต้นเปปไทด์ฉันใช้เวลามากมายในการดำน้ำในโลกที่น่าสนใจของความสัมพันธ์ระหว่างลำดับพื้นผิวเปปไทด์และความจำเพาะของเอนไซม์ มันเป็นหัวข้อที่ไม่เพียง แต่มีความสำคัญอย่างยิ่งในสาขาชีวเคมีเท่านั้น แต่ยังมีผลกระทบโดยตรงต่อสิ่งที่เราทำที่นี่ที่ บริษัท ของเรา
เริ่มต้นด้วยพื้นฐาน เอนไซม์เป็นเหมือนเครื่องโมเลกุลขนาดเล็กในร่างกายของเรา พวกเขาเร่งปฏิกิริยาทางเคมีที่จำเป็นต่อชีวิตเช่นการย่อยอาหารการผลิตพลังงานและการซ่อมแซมดีเอ็นเอ แต่นี่คือส่วนที่ยอดเยี่ยม: เอนไซม์จู้จี้จุกจิกเกี่ยวกับสิ่งที่พวกเขาทำงาน นั่นคือสิ่งที่ความจำเพาะของเอนไซม์เข้ามา
ความจำเพาะของเอนไซม์หมายความว่าเอนไซม์จะกระตุ้นปฏิกิริยาเฉพาะกับชุดของพื้นผิวเฉพาะ คิดว่ามันเหมือนล็อคและกุญแจ เอนไซม์คือล็อคและสารตั้งต้นเป็นกุญแจสำคัญ เฉพาะคีย์ที่เหมาะสม (สารตั้งต้น) เท่านั้นที่สามารถเข้ากับล็อค (เอนไซม์) และทำให้ปฏิกิริยาดำเนินต่อไป
ตอนนี้พื้นผิวเปปไทด์เป็นโซ่ของกรดอะมิโน ลำดับของกรดอะมิโนเหล่านี้ในสารตั้งต้นเปปไทด์เป็นสิ่งสำคัญเพราะมันกำหนดว่าสารตั้งต้นจะโต้ตอบกับเอนไซม์ได้ดีเพียงใด เช่นเดียวกับคีย์ที่แตกต่างกันมีรูปร่างที่แตกต่างกันลำดับเปปไทด์ที่แตกต่างกันมีคุณสมบัติทางเคมีและทางกายภาพที่แตกต่างกันซึ่งสามารถเข้ากันได้ดีกับเอนไซม์หรือไม่
หนึ่งในปัจจัยหลักที่ได้รับอิทธิพลจากลำดับพื้นผิวเปปไทด์คือความสัมพันธ์ที่มีผลผูกพันระหว่างสารตั้งต้นและเอนไซม์ ความสัมพันธ์ที่มีผลผูกพันนั้นเป็นสิ่งที่พื้นผิวติดกับเอนไซม์ สารตั้งต้นเปปไทด์ที่มีลำดับที่ตรงกับไซต์ที่ใช้งานของเอนไซม์อย่างใกล้ชิด (ส่วนหนึ่งของเอนไซม์ที่เกิดปฏิกิริยา) จะมีความสัมพันธ์ที่มีผลผูกพันสูง ซึ่งหมายความว่ามันจะผูกแน่นกับเอนไซม์และปฏิกิริยามีแนวโน้มที่จะเกิดขึ้นได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น
ตัวอย่างเช่นเอนไซม์บางตัวมีความเฉพาะเจาะจงมากเกี่ยวกับกรดอะมิโนในบางตำแหน่งในพื้นผิวเปปไทด์ สมมติว่าเอนไซม์ชอบกรดอะมิโนที่ไม่ชอบน้ำ (น้ำ - เกลียด) ในตำแหน่งใดตำแหน่งหนึ่ง หากสารตั้งต้นเปปไทด์มีกรดอะมิโน (น้ำ - รัก) ที่ตำแหน่งนั้นแทนความสัมพันธ์ที่มีผลผูกพันจะต่ำและเอนไซม์อาจไม่รู้จักพื้นผิวที่เป็นสิ่งที่สามารถทำงานได้
อีกแง่มุมหนึ่งคือประสิทธิภาพการเร่งปฏิกิริยา แม้ว่าสารตั้งต้นเปปไทด์สามารถผูกกับเอนไซม์ลำดับอาจส่งผลกระทบต่อความรวดเร็วของเอนไซม์ที่สามารถแปลงสารตั้งต้นเป็นผลิตภัณฑ์ได้ ลำดับสามารถมีอิทธิพลต่อการวางแนวของสารตั้งต้นในไซต์ที่ใช้งานอยู่ซึ่งจะส่งผลกระทบต่อกลไกการเกิดปฏิกิริยา หากสารตั้งต้นนั้นมุ่งเน้นอย่างถูกต้องพันธะเคมีสามารถหักและเกิดขึ้นได้ง่ายขึ้นนำไปสู่ปฏิกิริยาที่เร็วขึ้น
ลองมาดูตัวอย่างจริง - โลก Calpain เป็นเอนไซม์โปรตีเอสที่มีบทบาทสำคัญในกระบวนการเช่นการส่งสัญญาณเซลล์และการทำงานของกล้ามเนื้อcalpain inhibitor xiเป็นสารตั้งต้นเปปไทด์ที่ออกแบบมาเพื่อโต้ตอบกับ Calpain ลำดับที่เฉพาะเจาะจงของมันถูกสร้างขึ้นอย่างรอบคอบเพื่อให้มีความสัมพันธ์ที่มีผลผูกพันสูงสำหรับ Calpain ทำให้สามารถยับยั้งกิจกรรมของเอนไซม์ สิ่งนี้มีประโยชน์ในการวิจัยที่นักวิทยาศาสตร์ต้องการศึกษาบทบาทของ Calpain ในกระบวนการทางชีวภาพโดยเฉพาะ
อีกตัวอย่างคือz - val - phe - phe- สิ่งนี้ยังเกี่ยวข้องกับการยับยั้ง Calpain ลำดับของ z - val - phe - cho ได้รับการปรับให้เหมาะสมเพื่อให้พอดีกับไซต์ที่ใช้งานอยู่ของ Calpain และบล็อกฟังก์ชั่นของมัน โดยการทำความเข้าใจความสัมพันธ์ระหว่างลำดับพื้นผิวเปปไทด์และความจำเพาะของเอนไซม์นักวิจัยสามารถออกแบบสารยับยั้งเหล่านี้ได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น
แล้วก็มีSuc - llvy - AMC- มันเป็นสารตั้งต้นเปปไทด์ที่ใช้กันทั่วไปในการทดสอบกิจกรรมของ proteasomes ซึ่งเป็นคอมเพล็กซ์โปรตีนขนาดใหญ่ที่ทำลายโปรตีนที่ไม่พึงประสงค์ในเซลล์ ลำดับ LLVY ใน SUC - LLVY - AMC ได้รับการยอมรับจาก proteasome และเมื่อ proteasome แยกสารตั้งต้นจะปล่อยกลุ่มเรืองแสง (AMC) การเรืองแสงนี้สามารถวัดได้ทำให้นักวิจัยสามารถหาปริมาณกิจกรรม proteasome
ดังนั้นทำไมสิ่งนี้จึงสำคัญสำหรับเราในฐานะผู้จัดหาสารตั้งต้นเปปไทด์? ลูกค้าของเราซึ่งส่วนใหญ่เป็นนักวิจัยในอุตสาหกรรมเทคโนโลยีชีวภาพและเวชภัณฑ์พึ่งพาเราในการจัดหาพื้นผิวเปปไทด์ที่มีคุณภาพสูงพร้อมลำดับที่เหมาะสม พวกเขาต้องการพื้นผิวที่จะโต้ตอบกับเอนไซม์ที่พวกเขากำลังศึกษาโดยเฉพาะ หากลำดับปิดสารตั้งต้นจะไม่ทำงานตามที่คาดไว้และผลการวิจัยจะไม่ถูกต้อง
เราทำงานอย่างใกล้ชิดกับลูกค้าของเราเพื่อทำความเข้าใจความต้องการของพวกเขา ไม่ว่าพวกเขาจะศึกษาเอนไซม์ใหม่หรือพยายามพัฒนายาใหม่เราสามารถกำหนดเอง - สังเคราะห์พื้นผิวเปปไทด์ที่มีลำดับที่แน่นอนที่พวกเขาต้องการ ทีมผู้เชี่ยวชาญของเราใช้ความรู้ล่าสุดในชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุลเพื่อให้แน่ใจว่าลำดับเปปไทด์ที่เราผลิตนั้นได้รับการปรับให้เหมาะสมสำหรับความจำเพาะของเอนไซม์
หากคุณเป็นนักวิจัยที่ต้องการพื้นผิวเปปไทด์คุณจะรู้ว่าการมีสิ่งที่เหมาะสมคืออะไร เรามาที่นี่เพื่อช่วย พื้นผิวเปปไทด์ของเราทำด้วยวัสดุที่มีคุณภาพสูงและมาตรการควบคุมคุณภาพที่เข้มงวด เรานำเสนอพื้นผิวที่ทำล่วงหน้าที่หลากหลายรวมถึงตัวเลือกสำหรับการสังเคราะห์ที่กำหนดเอง ไม่ว่าคุณจะทำงานในการทดลองขนาดเล็กหรือโครงการพัฒนายาขนาดใหญ่เราสามารถจัดหาพื้นผิวเปปไทด์ที่จะตอบสนองความต้องการเฉพาะของคุณ
หากคุณสนใจที่จะเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับผลิตภัณฑ์ของเราหรือมีคำถามใด ๆ เกี่ยวกับลำดับพื้นผิวเปปไทด์และความจำเพาะของเอนไซม์อย่าลังเลที่จะเข้าถึง เรายินดีที่จะมีการแชทและอภิปรายว่าเราจะช่วยเหลือคุณในการวิจัยของคุณได้อย่างไร
โดยสรุปความสัมพันธ์ระหว่างลำดับพื้นผิวเปปไทด์และความจำเพาะของเอนไซม์เป็นพื้นที่ที่ซับซ้อน แต่น่าสนใจของการศึกษา มันมีความหมายถึงผลกระทบทางชีวเคมียาและเทคโนโลยีชีวภาพ ในฐานะผู้จัดหาสารตั้งต้นเปปไทด์เราอยู่ในระดับแนวหน้าของสาขานี้โดยให้เครื่องมือที่นักวิจัยต้องทำการค้นพบใหม่และพัฒนาชีวิต - การเปลี่ยนแปลงการรักษา
การอ้างอิง
- Strier, L. , Berg, JM, & Tymical, JL (2002) นักชีวเคมี (5th ed.) WH Freeman
- Creighton, TE (1993) โปรตีน: โครงสร้างและคุณสมบัติระดับโมเลกุล (2nd ed.) WH Freeman
- Fersht, AR (1999) โครงสร้างและกลไกในวิทยาศาสตร์โปรตีน: คู่มือการเร่งปฏิกิริยาของเอนไซม์และการพับโปรตีน WH Freeman