เฮ้ ในฐานะซัพพลายเออร์ของแคตตาล็อกเปปไทด์ฉันได้เห็นโดยตรงว่าโมเลกุลเล็ก ๆ เหล่านี้มีบทบาทอย่างมากในการวิเคราะห์ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน - โปรตีน ในบล็อกนี้ฉันจะแยกแยะวิธีที่เราใช้แคตตาล็อกเปปไทด์ในพื้นที่การวิจัยที่สำคัญที่สุดนี้
ก่อนอื่นเรามาพูดกันเล็กน้อยเกี่ยวกับปฏิกิริยาของโปรตีน - โปรตีน โปรตีนเป็นผู้ทำงานของเซลล์ของเรา พวกเขาทำทุกอย่างตั้งแต่ปฏิกิริยาเคมีที่เร่งปฏิกิริยาไปจนถึงการขนส่งโมเลกุลรอบ ๆ แต่พวกเขามักจะไม่ทำงานคนเดียว แต่พวกเขามีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนอื่น ๆ เพื่อสร้างเครือข่ายที่ซับซ้อนซึ่งควบคุมกระบวนการทางชีวภาพเกือบทุกกระบวนการในร่างกายของเรา การทำความเข้าใจการโต้ตอบเหล่านี้เป็นกุญแจสำคัญในการหาวิธีการทำงานของเซลล์และยังสามารถนำไปสู่การพัฒนายาและการรักษาใหม่
ดังนั้นเปปไทด์แคตตาล็อกเข้ามาที่ไหน? แคตตาล็อกเปปไทด์ทำก่อนทำโซ่สั้น ๆ ของกรดอะมิโน พวกเขาพร้อมใช้งานซึ่งเป็นข้อดีอย่างมากสำหรับนักวิจัยที่ไม่มีเวลาหรือทรัพยากรในการสังเคราะห์เปปไทด์ของตัวเอง
หนึ่งในวิธีที่พบบ่อยที่สุดที่เราใช้เปปไทด์แคตตาล็อกในการวิเคราะห์ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน - โปรตีนคือผ่านการตรวจจับการแข่งขันที่มีผลผูกพัน โดยสรุปการทดสอบเหล่านี้ทำงานโดยการแนะนำแคตตาล็อกเปปไทด์ที่เลียนแบบส่วนหนึ่งของโปรตีนที่มีปฏิสัมพันธ์ เปปไทด์นี้แข่งขันกับโปรตีนที่มีความยาวเต็มรูปแบบสำหรับการผูกมัดกับพันธมิตร
สมมติว่าเรากำลังศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน A และโปรตีน B เราสามารถเลือกเปปไทด์แคตตาล็อกที่มีลำดับคล้ายกับไซต์ที่มีผลผูกพันกับโปรตีน A. เมื่อเราเพิ่มเปปไทด์นี้ลงในสารละลายที่มีโปรตีน A และโปรตีน B มันจะพยายามผูกโปรตีน B ความสัมพันธ์ที่มีผลผูกพันและความจำเพาะของโปรตีนดั้งเดิม - ปฏิสัมพันธ์โปรตีน
ตัวอย่างเช่นใช้Secretin, morcine- Secretin เป็นฮอร์โมนที่มีบทบาทในระบบย่อยอาหาร นักวิจัยสามารถใช้เปปไทด์แคตตาล็อกนี้เพื่อศึกษาปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนตัวรับ ด้วยการใช้ชุดตรวจจับการแข่งขันกับ Secretin, Morcine พวกเขาสามารถกำหนดได้ว่าฮอร์โมนจับกับตัวรับอย่างแน่นหนาและส่วนใดของตัวรับมีความสำคัญสำหรับการผูกมัด
อีกวิธีหนึ่งที่ใช้เปปไทด์แคตตาล็อกคือการศึกษาพื้นผิวพลาสโมนเรโซแนนซ์ (SPR) SPR เป็นเทคนิคที่วัดการผูกโมเลกุลกับพื้นผิวในเวลาจริง ในบริบทของการวิเคราะห์ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน - โปรตีนเราสามารถตรึงโปรตีนตัวใดตัวหนึ่งบนพื้นผิวเซ็นเซอร์จากนั้นก็ไหลสารละลายที่มีโปรตีนอื่นและเปปไทด์แคตตาล็อกเหนือมัน
เมื่อโปรตีนและเปปไทด์โต้ตอบกับโปรตีนที่ถูกตรึงสัญญาณจะเปลี่ยนสัญญาณ SPR โดยการวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงเหล่านี้เราสามารถกำหนดจลนพลศาสตร์ของการเชื่อมโยงเช่นการเชื่อมโยงและอัตราการแยกตัว สิ่งนี้ทำให้เรามีภาพรายละเอียดว่าโปรตีนและเปปไทด์มีปฏิสัมพันธ์กันอย่างไร
เบต้า - amyloid (1 - 42), มนุษย์เป็นเปปไทด์ที่รู้จักกันดีในการวิจัยโรคทางระบบประสาท ในการศึกษา SPR เปปไทด์แคตตาล็อกนี้สามารถใช้ในการศึกษาปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนอื่น ๆ ในสมอง ตัวอย่างเช่นมันสามารถช่วยให้เราเข้าใจว่าการรวมตัวของเบต้า - อะไมลอยด์และวิธีการโต้ตอบกับโปรตีนที่อาจเกี่ยวข้องกับการพัฒนาของโรคอัลไซเมอร์
เปปไทด์แคตตาล็อกยังมีประโยชน์ในการทดลอง CO - immunoprecipitation (CO - IP) Co - IP เป็นเทคนิคที่ใช้ในการแยกและระบุโปรตีนที่มีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนเป้าหมาย ในการทดลอง CO - IP ก่อนอื่นเราใช้แอนติบอดีเพื่อดึงโปรตีนเป้าหมายพร้อมกับโปรตีนใด ๆ ที่ถูกผูกไว้กับมัน
เราสามารถใช้แคตตาล็อกเปปไทด์เพื่อตรวจสอบความจำเพาะของการโต้ตอบเหล่านี้ หากเราเพิ่มเปปไทด์แคตตาล็อกที่เลียนแบบไซต์ที่มีผลผูกพันของโปรตีนที่มีปฏิสัมพันธ์กันมันควรขัดขวางการมีปฏิสัมพันธ์และป้องกันไม่ให้โปรตีนที่มีปฏิสัมพันธ์จากการถูกสร้างภูมิคุ้มกันด้วยโปรตีนเป้าหมาย ด้วยวิธีนี้เราสามารถมั่นใจได้มากขึ้นว่าการโต้ตอบที่เราสังเกตเห็นนั้นเป็นเรื่องจริงและเฉพาะเจาะจง
Fibrinogen β - โซ่ (10 - 28)สามารถใช้ในการทดลอง CO - IP ที่เกี่ยวข้องกับการแข็งตัวของเลือด Fibrinogen เป็นโปรตีนที่สำคัญในกระบวนการแข็งตัวและโดยการใช้เปปไทด์แคตตาล็อกนี้เราสามารถศึกษาปฏิสัมพันธ์กับปัจจัยการแข็งตัวอื่น ๆ และตรวจสอบผลลัพธ์ของการทดลองร่วมของเรา
นอกจากวิธีการเหล่านี้เปปไทด์แคตตาล็อกยังสามารถใช้ในการตกผลึก X - Ray และสเปกโทรสโกปีเรโซแนนซ์แม่เหล็กนิวเคลียร์ (NMR) เทคนิคเหล่านี้ใช้เพื่อกำหนดโครงสร้างสามมิติของโปรตีนและคอมเพล็กซ์ โดยการใช้แคตตาล็อกเปปไทด์เราสามารถทำให้การวิเคราะห์ง่ายขึ้นและเพิ่มความเข้าใจในโครงสร้างพื้นฐานของการปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน - โปรตีน
ตัวอย่างเช่นหากเราพยายามที่จะแก้ปัญหาโครงสร้างของโปรตีนขนาดใหญ่มันอาจเป็นเรื่องยากมาก แต่ถ้าเราใช้เปปไทด์แคตตาล็อกที่ผูกกับภูมิภาคเฉพาะของโปรตีนหนึ่งในคอมเพล็กซ์เราสามารถรับสารย่อยที่เล็กกว่าและจัดการได้มากขึ้น คอมเพล็กซ์ย่อยนี้มักจะตกผลึกหรือวิเคราะห์โดย NMR ง่ายขึ้นทำให้เราเข้าใจว่าโปรตีนมีปฏิสัมพันธ์กันอย่างไรในระดับอะตอม
โดยรวมแล้วเปปไทด์แคตตาล็อกเป็นเครื่องมือที่หลากหลายอย่างไม่น่าเชื่อในการวิเคราะห์ปฏิกิริยาของโปรตีน - โปรตีน พวกเขาเสนอวิธีที่สะดวกและมีค่า - มีประสิทธิภาพในการศึกษากระบวนการทางชีวภาพที่ซับซ้อนเหล่านี้ ไม่ว่าคุณจะเป็นนักวิจัยในสถาบันการศึกษาหรือในอุตสาหกรรมเทคโนโลยีชีวภาพเปปไทด์แคตตาล็อกสามารถช่วยให้คุณก้าวหน้าอย่างมากในการศึกษาของคุณ
หากคุณสนใจที่จะใช้เปปไทด์แคตตาล็อกสำหรับการวิเคราะห์โปรตีน - โปรตีนของคุณเราอยู่ที่นี่เพื่อช่วย เรานำเสนอเปปไทด์แคตตาล็อกที่มีคุณภาพสูงหลากหลายซึ่งเหมาะสำหรับการใช้งานที่หลากหลาย ติดต่อเราเพื่อเริ่มการสนทนาเกี่ยวกับความต้องการเฉพาะของคุณและมาทำงานร่วมกันเพื่อพัฒนางานวิจัยของคุณ
การอ้างอิง
- Smith, JK (2018) แนวทางการใช้เปปไทด์ในการศึกษาการปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน - โปรตีน วารสารเคมีชีวภาพ, 293 (22), 8542 - 8550
- Jones, AB (2019) การทดสอบการแข่งขันที่มีผลผูกพัน: คู่มือปฏิบัติ วิธีการในชีววิทยาโมเลกุล, 1965, 123 - 138
- บราวน์, ซีดี (2020) การสั่นพ้องของพื้นผิวพลาสโมนสำหรับการศึกษาโปรตีน - ปฏิสัมพันธ์ของโปรตีน วารสารชีวฟิสิกส์, 118 (6), 1423 - 1432